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Peptide Pinealon – Tripeptide (Glu-Asp-Arg or EDR)

Il Pinealon è un peptide sintetico.

Il Pinealon è un peptide sintetico contenente tre residui amminoacidici legati in un ordine specifico. Un residuo amminoacidico è un amminoacido che fa parte di una catena. In questo caso si tratta di residui di acido glutammico, acido aspartico e arginina. Il nome Pinealon si riferisce alla struttura definita, descritta anche dall'abbreviazione EDR. Il termine „sintetico” indica il metodo di ottenimento, mentre „tripeptide” indica la lunghezza della catena. Queste informazioni possono essere lette indipendentemente dalla direzione della ricerca sul composto. Non è necessario attribuirgli specifici risultati biologici per spiegarne l'identità. La base della descrizione rimane la sequenza e la forma chimica completa del materiale in questione. [1,2]

La sequenza di amminoacidi del Pinealon è Gln-Ala-Glu-Pro-Arg-Asp

La sequenza del Pinealon è Glu-Asp-Arg. Le successive abbreviazioni indicano acido glutammico, acido aspartico e arginina. La notazione si legge nell'ordine indicato, poiché rappresenta una catena ordinata e non un elenco casuale di ingredienti. Le abbreviazioni EDR e Glu-Asp-Arg trasmettono la stessa informazione di base. La prima notazione utilizza una lettera per amminoacido, la seconda tre. L'inversione di due elementi modificherebbe il peptide descritto. Pertanto, durante la trascrizione del nome o la traduzione del testo, è necessario preservare l'ordine di tutti e tre i residui. Ciò consente di distinguere il Pinealon da altri tripeptidi, compresi quelli che hanno una composizione simile ma una sequenza diversa. [1]

Cosa significa l'abbreviazione EDR?

EDR è una notazione a una sola lettera della sequenza del Pinealon: E indica l'acido glutammico, D l'acido aspartico e R l'arginina. Le lettere derivano dal sistema accettato di codici degli amminoacidi e non devono necessariamente corrispondere alle iniziali dei loro nomi polacchi. Grazie a ciò, la notazione rimane comprensibile nelle pubblicazioni in diverse lingue. La versione E-D-R che si incontra mostra lo stesso ordine; i trattini servono unicamente a separare i simboli. L'abbreviazione deve essere interpretata nel contesto della chimica dei peptidi, poiché al di fuori di quest'area potrebbe avere altri significati. La ricerca del composto completo „Pinealon Glu-Asp-Arg” aiuta a garantire che il testo trovato riguardi il composto corretto e non una denominazione casualmente simile. [1,3]

Perché il Pinealon si chiama tripeptide?

Il prefisso „tri-” significa tre e si riferisce qui al numero di residui amminoacidici nella catena. Il pinealon contiene tre residui, quindi è un tripeptide. Questa classificazione descrive la lunghezza, ma non indica ancora la piena identità. Esistono molti tripeptidi con altri amminoacidi o con un altro loro ordine. Solo l'aggiunta della sequenza Glu-Asp-Arg permette di riconoscere la struttura in questione. Non bisogna inoltre trarre conclusioni sul comportamento del composto basandosi esclusivamente sulla sua esigua lunghezza. Una catena di tre residui è facile da scrivere in una sola riga, ma le dimensioni non costituiscono una descrizione completa delle proprietà. Nel testo introduttivo, la definizione „tripeptide sintetico EDR” è una caratteristica concisa e precisa.

Pinealon contiene tre diversi aminoacidi?

Sì. Nella sequenza EDR ciascuno dei tre tipi di amminoacidi è presente una volta sola. Non ci sono ripetizioni: la prima posizione corrisponde all'acido glutammico, la seconda all'acido aspartico e la terza all'arginina. Il numero dei tipi di amminoacidi è quindi in questo caso pari al numero dei residui. Si tratta tuttavia di due concetti distinti. Il „tipo” indica quale componente è presente, mentre la „posizione” ne determina il posto nella catena. La sola conoscenza dei tre nomi non permette ancora di distinguere tutti i possibili ordinamenti. Perciò nella descrizione del Pinealon è opportuno mantenere la sequenza completa, invece di limitarsi alla frase sulla presenza di tre amminoacidi. Questa piccola specificazione rimuove una significativa ambiguità.

Il Pinealon è una miscela di aminoacidi liberi?

No. Il Pinealon è un singolo composto in cui i residui di aminoacidi sono uniti da legami peptidici. Una miscela di molecole separate di acido glutammico, acido aspartico e arginina avrebbe una descrizione chimica diversa. La semplice combinazione di questi ingredienti insieme non dimostra la formazione di EDR. Inoltre, il mantenimento delle giuste proporzioni non conferma la loro unione in una sequenza specifica. Questa distinzione è importante quando si leggono le informazioni sulla composizione: „contiene gli aminoacidi presenti nel Pinealon” non significa la stessa cosa di „contiene il Pinealon identificato”. La prima frase descrive i componenti, la seconda una specifica struttura. Le proprietà degli aminoacidi liberi non dovrebbero essere automaticamente attribuite al peptide che contiene i loro residui.

Perché l'ordine dei residui nell'EDR è importante?

L'ordine indica quali residui sono collegati tra loro e quali posizioni occupano. Nel Pinealon, l'acido aspartico si trova tra l'acido glutammico e l'arginina. La permutazione dei residui porterebbe a una struttura distinta, anche se l'elenco dei tipi di amminoacidi rimarrebbe lo stesso. Ad esempio, Asp-Glu-Arg non sarebbe un modo diverso di scrivere il Pinealon. I peptidi con sequenza permutata possono avere la stessa composizione elementare, quindi la sola corrispondenza di massa non risolve tutte le differenze. Vale la pena controllare l'ordine dei codici nel testo, nella tabella e nell'illustrazione. Ognuno di questi elementi dovrebbe rappresentare la stessa sequenza, se si riferisce all'EDR di base.

Dove si trovano l'inizio e la fine della catena del Pinealon?

Di norma la sequenza si scrive dall'estremità amminica, indicata come N, a quella carbossilica, indicata come C. Nel Pinealon il primo residuo è l'acido glutammico e l'ultimo è l'arginina. I termini „inizio” e „fine” si riferiscono alla direzione di scrittura e non a una posizione fissa della molecola nello spazio. Non significano che debba avere la stessa forma in ogni disegno. Tuttavia, non è consentito invertire liberamente l'ordine dei simboli nella sequenza standard. Le informazioni sulle estremità sono di particolare importanza quando si descrivono i derivati, poiché è proprio lì che può trovarsi un'ulteriore modifica chimica. In tal caso, le tre lettere EDR non devono necessariamente rappresentare la descrizione completa del materiale.

Questo codice rappresenta la sequenza di un tripeptide (un piccolo peptide composto da tre amminoacidi). Nel dettaglio: - **H-**: indica il gruppo amminico libero ($NH_2$) all'estremità N-terminale. - **Glu**: acido glutammico. - **Asp**: acido aspartico. - **Arg**: arginina. - **-OH**: indica il gruppo carbossilico libero ($COOH$) all'estremità C-terminale. Quindi, indica il tripeptide acido glutammico-acido aspartico-arginina nella sua forma non protetta.

Questo è un modo più completo per presentare la struttura di base del Pinealon. Glu-Asp-Arg mostra tre residui, mentre H e OH si riferiscono alle estremità della molecola. Non indicano aminoacidi aggiuntivi, quindi il peptide contiene comunque tre posizioni nella catena. Questa notazione si trova nel record ChEBI per EDR. Permette di distinguere le informazioni sulla sequenza stessa dalla descrizione che include anche i gruppi terminali. Se nel nome di un altro materiale è presente un'ulteriore indicazione di modifica, questa deve essere conservata e spiegata. La rimozione di tutti i caratteri tranne la sequenza potrebbe far perdere una differenza importante. Un nome più lungo non significa necessariamente una catena più lunga, ma può contenere maggiori dettagli sulla sua struttura. [1]

Qual è la differenza strutturale tra il Pinealon e l'Epitalon?

Il Pinealon ha la sequenza Glu-Asp-Arg, mentre l'Epitalon Ala-Glu-Asp-Gly. Il primo è un tripeptide, il secondo un tetrapeptide. Differiscono quindi per lunghezza e composizione della catena ordinata. Il tratto comune Glu-Asp non li rende la stessa molecola. Tale accostamento è un confronto strutturale e non indica quale composto sia „migliore” né quale risultato produrrebbe. Per il lettore la cosa più importante è che i nomi non vengano usati in modo intercambiabile. Anche la somiglianza dell'argomento della pubblicazione non elimina la differenza strutturale. Nel trasferimento di dati tra tabelle, si devono mantenere il nome e la sequenza del composto a cui si riferisce effettivamente la fonte. Il Pinealon non è un'abbreviazione del nome Epitalon. [1,4]

La somiglianza tra i nomi dei peptidi indica una struttura simile?

Non è necessario. Il nome Pinealon consente di riconoscere il composto in un determinato contesto, ma non sostituisce la sua sequenza. Due peptidi discussi nello stesso gruppo tematico possono avere un numero diverso di residui e una composizione differente. A sua volta, lo stesso EDR può comparire con il nome Pinealon o con la dicitura Glu-Asp-Arg. Per distinguere un sinonimo da un'altra sostanza, vale la pena confrontare la struttura e il nome completo del materiale. Particolare attenzione richiedono le note relative a modifiche o frammenti. Queste possono indicare un effettivo cambiamento chimico e non una variante ortografica. Un confronto chiaro inizia quindi dalla sequenza, anziché da una simile sonorità o da una comune categoria di articoli.

Qual è la formula molecolare e la massa molare del Pinealon?

Per la struttura di base del Pinealon vengono indicati la formula C₁₅H₂₆N₆O₈ e un peso molecolare di circa 418,4 g/mol. La formula indica il numero di atomi di carbonio, idrogeno, azoto e ossigeno, mentre la sequenza descrive l'ordine dei residui amminoacidici. Entrambe le registrazioni trasmettono informazioni diverse sulla stessa molecola. Il valore del peso molecolare non è né una dose né il contenuto di una specifica confezione. Inoltre, non conferma di per sé la composizione di un qualsiasi campione denominato Pinealon. Se il materiale contiene ingredienti aggiuntivi o la modifica descritta, la sua caratterizzazione completa richiede una maggiore precisione. I parametri dell'EDR di base devono essere riferiti proprio a questa struttura, e non automaticamente all'intero materiale studiato. [1]

Che cosa significa la lettera L negli amminoacidi del Pinealon?

Nella struttura di base dell'EDR sono presenti residui di acido L-glutammico, acido L-aspartico e L-arginina. La denominazione L si riferisce a una specifica disposizione spaziale degli atomi. Non indica il lato sinistro del disegno né l'ordine nella catena. Si tratta di un'informazione aggiuntiva sulla struttura, distinta dalla sequenza. La lettera D nell'abbreviazione EDR non deve inoltre essere confusa con la designazione della configurazione D. Nella sequenza questa lettera indica l'acido aspartico. Il significato deriva dal contesto della notazione. Quando si discute di un derivato modificato, le designazioni della configurazione dovrebbero rimanere visibili, poiché la loro omissione potrebbe offuscare la differenza tra le strutture. L'introduzione al Pinealon non richiede ulteriori dettagli stereochimici. [1,3]

Che cosa significa il termine „bioregolatore peptidico” nei testi su Pinealon?

Questo termine è legato al filone di ricerca sui peptidi brevi e sui processi cellulari. Nella descrizione del Pinealon, va considerato come un elemento della terminologia riscontrata in letteratura e non come una conferma indipendente di una specifica azione. Esso non fornisce il numero di residui, il loro ordine e nemmeno il meccanismo completo. L'informazione chimica più accurata rimane „tripeptide Glu-Asp-Arg”. L'appartenenza stessa alla categoria non implica inoltre l'identità con altri peptidi definiti in modo simile. Nell'articolo principale è possibile spiegare il significato di questo nome senza aggiungere garanzie sulla regolazione di un tessuto specifico o sul miglioramento della sua funzione. Il nome della categoria e il risultato dell'esperimento svolgono ruoli diversi e non dovrebbero sostituirsi a vicenda.

Il Pinealon marcato con fluorescenza è lo stesso materiale dell'EDR di base?

L'inclusione di un marcatore fluorescente introduce un elemento aggiuntivo utilizzato per l'osservazione. Pertanto, nella descrizione, il materiale marcato deve essere distinto dal peptide non modificato. Nello studio di Fedoreyeva e coautori sono stati analizzati, tra le altre cose, brevi peptidi marcati in cellule HeLa coltivate. Le informazioni sul marcatore e sul tipo di cellula fanno parte di questo esperimento e non sono un dettaglio superfluo. Nelle FAQ sulle basi, la cosa più importante è riconoscere la differenza tra la struttura di riferimento e il materiale preparato per la misurazione. Sulla base del solo segnale, non si dovrebbero attribuire garanzie generali sulla penetrazione del Pinealon non modificato in tutti i tessuti. Una tale domanda richiederebbe una revisione separata dei dati pertinenti. [5]

Il frammento del Pinealon è il peptide completo EDR?

No. Il frammento copre solo una parte della sequenza. Ad esempio, Glu-Asp conterrebbe due residui e quindi non corrisponderebbe al Pinealon completo. La distinzione rimane importante anche quando il composto più corto è descritto nella stessa pubblicazione. Il nome frammento indica una relazione strutturale, ma non spiega ancora il metodo di ottenimento. Tale materiale può essere sintetizzato deliberatamente o derivare da un determinato processo di trasformazione. Non bisogna presumere la sua presenza esclusivamente sulla base della sequenza del composto di partenza. Nel testo vale la pena mantenere il nome di ciò che è stato effettivamente analizzato, anziché raggruppare tutte le strutture più corte sotto la denominazione generale di Pinealon. Ciò facilita il corretto confronto delle informazioni.

Il Pinealon sintetico contiene aminoacidi presenti in natura?

Sì, la sua struttura comprende residui di amminoacidi presenti anche nei sistemi biologici. Ciò non significa tuttavia che il Pinealon finito sia stato isolato da essi, né che sia stata descritta la sua formazione naturale come peptide indipendente. È necessario separare l'origine dei componenti dal metodo di ottenimento dell'intera struttura. La parola „sintetico” si riferisce alla creazione pianificata del composto con metodi chimici. Non è una valutazione indipendente della qualità o della sicurezza. Nel caso di un materiale specifico, la conformità alla sequenza attesa richiede dati adeguati. La sola presenza di amminoacidi noti non conferma che abbiano formato una catena EDR ordinata. Pertanto, la descrizione dell'origine dovrebbe accompagnare le informazioni sulla struttura, anziché sostituirle.

Il Pinealon è una proteina?

Pinealon si descrive come un breve peptide, più precisamente un tripeptide. Questa definizione è sufficientemente precisa per la sequenza a tre residui EDR. Non è necessario stabilire un unico limite di lunghezza universale tra tutti i peptidi e le proteine per denominare correttamente questo composto. È più importante preservare l'informazione specifica sul numero e sulla sequenza dei residui. Inoltre, l'eventuale interazione dell'EDR con una molecola più grande non ne modifica automaticamente la classificazione. Il contatto tra i composti non significa di per sé che si sia formato un unico catena comune. Nelle descrizioni del Pinealon è quindi opportuno separare la questione della sua struttura da quella del materiale con cui è stato confrontato in un determinato studio.

Il nome Pinealon conferma la composizione di un campione specifico?

No. Il nome indica la relazione attesa, mentre i risultati analitici forniscono informazioni sul materiale specifico. Identità, purezza e titolo sono concetti distinti. L'identità riguarda il riconoscimento della struttura, il titolo la quantità della sostanza da determinare e la purezza la composizione valutata nell'ambito del metodo applicato. L'inclusione della sequenza EDR in un documento non sostituisce queste misurazioni. Allo stesso modo, una voce in un database chimico descrive un'entità definita e non tutti i campioni contrassegnati con il suo nome. Per un lettore principiante è sufficiente ricordare questa differenza. L'articolo sul Pinealon spiega la struttura di riferimento, ma non approva la composizione o la qualità di qualsiasi materiale che vi faccia riferimento.

A quale filone di ricerca è legata la storia del Pinealon?

Il Pinealon è discusso nella letteratura relativa ai brevi peptidi sintetici, legata tra gli altri ai lavori di Vladimir Khavinson e coautori. Un esempio è la pubblicazione di Arutyunyan e collaboratori del 2012, in cui vengono indicati il nome Pinealon e la sequenza Glu-Asp-Arg. Tali informazioni documentano la presenza del composto in un determinato filone di ricerca, ma non stabiliscono autonomamente la data della prima sintesi né tutti gli autori dello studio. La storia dettagliata richiederebbe fonti relative alle singole fasi. In una FAQ di base è sufficiente indicare il contesto senza attribuire al peptide popolarità, unicità o risultati attesi. I nomi e le affiliazioni aiutano a trovare i lavori, ma non sostituiscono la descrizione del loro ambito. [2]

Disclaimer

Il contenuto ha uno scopo puramente educativo e informativo. Il pinealon non è stato approvato dalla FDA per trattare, prevenire o diagnosticare alcuna malattia. La maggior parte dei dati disponibili proviene da studi di laboratorio, su animali o da studi clinici limitati sull'uomo. Sono necessarie ulteriori ricerche per valutare appieno la sicurezza e l'efficacia di questo peptide. I prodotti di ricerca offerti da fornitori come Semax Polska sono destinati esclusivamente a usi scientifici e di laboratorio. Le FAQ hanno uno scopo educativo e riguardano la nomenclatura, la storia e la struttura del pinealon. Non costituiscono un consiglio medico, una raccomandazione d'acquisto o istruzioni per la preparazione, il dosaggio o l'uso. La descrizione della struttura non conferma la sicurezza o la qualità di uno specifico materiale.

Riferimenti

  1. EMBL-EBI. ChEBI:156374 — Glu-Asp-Arg. Definizione della struttura, sinonimi e parametri chimici.

  2. Arutjunyan, A. V., Kozina, L. S., Stvolinsky, S. L., Bulygina, E. R., Mashkina, A. P., & Khavinson, V. K. (2012). Il Pinealon protegge la prole di ratto dall'iperomocisteinemia prenatale. International Journal of Peptides, 2012, 109757. Testo completo.

  3. Commissione congiunta IUPAC-IUB sulla nomenclatura biochimica. Nomenclatura e simbolismo per amminoacidi e peptidi: Raccomandazioni 1983, sezioni 3AA-1 e 3AA-2. Nomi e simboli degli amminoacidi.

  4. National Center for Biotechnology Information. Sintesi del composto PubChem per CID 219042, Epitalon. Record Epitalonu.

  5. Fedoreyeva, L. I., Kireev, I. I., Khavinson, V. K., & Vanyushin, B. F. (2011). Penetrazione di peptidi fluorescenti corti nel nucleo di cellule HeLa e interazione specifica in vitro dei peptidi con deossiribooligonucleotidi e DNA. Biochemistry (Moscow), 76(11), 1210–1219. Pubblicazione.

  6. Dati chimici e di voce relativi a Pinealon (peptide EDR). https://en.wikipedia.org/wiki/Pinealon/
  7. PubChem. (n.d.). Pinealon (CID 10273502). National Center for Biotechnology Information. https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/compound/10273502 
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